问题：
什么是反式作用因子？常见的DNA结合域有？
答案：
一些与顺式作用元件相互作用并调节基因转录的蛋白质分子称为转录调节蛋白或转录因子，也成反式作用因子。编码反式作用因子的基因与被反式作用因子调控的靶序列（基因）不在同一染色体上。反式作用因子有两个重要的功能结构域：DNA结合结构域和转录活化结构域。主要的DNA结合域包括：
螺旋－转折－螺旋（HTH）及同源结构域：绝大部分原核生物调节蛋白属于HTH，HTH是一个20个氨基酸残基组成的区域，包括两个α螺旋，一个处于DNA的大沟，称为识别螺旋；许多真核生物的转录调节蛋白也包含HTH结构，如同源异形蛋白（homeodomain，HD），HD由60个氨基酸残基组成。
锌指（Zn-finger），锌指是某些蛋白质分子中由若干保守的氨基酸残基同锌离子结合，形成相对独立的“指”状四面体结构。CXHY中的XY表示与Zn配位结合的半胱氨酸的组氨酸。
亮氨酸拉链（leucinezipper），有这种结构的蛋白质常以同源二聚体或异源二聚体的形式与DNA结合。这些蛋白的结合区可以分为两部分：一为碱性区（结合区），它与DNA结合，此区含有许多具有亲水性的氨基酸；与碱性区相连的是7个一套的氨基酸残基连续排列，每第七个都是疏水的亮氨酸残基。二聚体的形成对与DNA的结合是必要的，但结合的不是拉链区而是碱性亲水区。
螺旋－环－螺旋（HLH），HLH模体含有40多个氨基酸残基，在2个具有两性特征的α螺旋之间有一个长度可变的连接区（loop）。通过α螺旋的相互作用，HLH蛋白能够形成同源或异源二聚体，环的存在可以保证两个α螺旋独立的起作用。